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補助金に係る消費税及び地方消費税の仕入控除税額について（令和４年度新型コロナウイルス感染症緊急包括支援交付金（医療分）事業分）
新型コロナウイルス感染症緊急包括支援交付金（医療分）事業に係る補助金の交付を受けた事業者は、補助事業完了後に消費税及び地方消費税（以下、「消費税等」という。）に係る仕入控除税額が確定した場合は、県に報告していただく必要があります。（仕入控除税額が０円の場合を含む）
このうち、下記「２ 報告対象」の補助金の交付を受けた事業者については、仕入控除税額報告書等を提出していただきますようお願いします。
※他の事業に関することは、各事業課に直接お問い合わせください。
新着情報
令和６年３月１５日（金） 県から事業者へ提出依頼メールを送信しました。
目次
１ 仕入税額控除とは
（１）消費税の仕組み
消費税は、生産、流通、販売などの各段階において、商品の販売やサービスの提供などの取引に対して課される税金で、最終的に商品を消費し、又はサービスの提供を受ける消費者が負担しますが、納付は各段階の事業者が行います。
各段階で二重、三重に課税されることのないよう、「課税売上げに係る消費税額」から「課税仕入れ等に係る消費税額」を控除し、税が累積しない仕組みとなっています（仕入税額控除制度）。
下図における「小売業者」の場合、消費税４「１０,０００円」から消費税３「７,０００円」を控除した「３,０００円」が消費税の納付額となります。
（２）補助金の収入と消費税の仕入税額控除
補助金の収入は、非課税売上げとして計上されるため、消費税の課税対象外となります。
一方、補助対象事業者が補助事業において支払った経費に含まれる消費税は、仕入税額控除の対象とすることができます。
補助金に係る消費税について、仕入税額控除を受けた際は、控除額に含まれる補助金額が事業者に重複して交付されたことになるため、県に返還しなければなりません。
※消費税や仕入控除税額等の制度の詳細については、国税庁のHPをご確認ください。
２ 報告対象
以下の補助金の交付を受けた事業者が報告対象です。
※県への報告は、返還の有無に関わらず、補助金の交付を受けた全ての事業者に必要です。
３ 提出期限
令和６年（２０２４年）４月３０日（火）
（報告書等を、指定の電子メールアドレス（coronazigyou4@pref.fukuoka.lg.jp）へ提出してください。）
４ 提出前の確認事項
必ず、以下の内容をご確認のうえ、報告してください。
なお、提出に関する詳細については「令和４年度新型コロナウイルス感染症緊急包括支援交付金（医療分）事業に係る消費税及び地方消費税の仕入控除税額（返還額）の報告について（事業者向け手引き）」に記載しておりますので、ご一読ください。
（１）仕入控除税額（返還額）の有無
仕入控除税額（返還額）があるかは、フローチャートを参照してください。
（２）提出書類
Ａ 仕入控除税額報告書（様式第２号及び入力用シート）
令和４年度に、同一事業で複数回の交付決定を受けている場合（同一年度内で期間を分けて募集を行った補助金）は、交付決定ごとに作成してください。
なお、変更交付決定については、複数回の交付決定を受けている場合に該当しないので、最後の変更交付決定のみをもとに作成してください。
例：★★事業（４月～６月）及び★★事業（１０月～１２月）の同一事業で、令和４年度に２回交付決定を受けた場合
→（４月～６月）と（１０月～１２月）をそれぞれ作成してください。
Ｂ 消費税等の確定申告書（第３－（１）号様式、または第27－（１）号様式）の写し
（返還額なし２の場合は、簡易課税用の消費税等の確定申告書（第３－（３）号様式、または第27－２号様式）の写し）
補助金の交付決定を受けた年度（令和４年度）のものを添付してください。
Ｃ 特定収入割合の計算過程が分かる書類（任意様式）
Ｄ 消費税等の確定申告書に係る付表2-3、付表2-1、または付表2-2（課税売上割合・控除対象仕入税額等の計算書）の写し
|
番号 |
A |
B |
C |
|---|---|---|---|
| １ | 〇 | ||
| ２ | 〇 | 〇（※２） | |
| ３ | 〇 | 〇 | 〇 |
| ４ | 〇 | 〇 | |
| ５ | 〇 | 〇 |
|
番号 |
A |
B |
D |
|---|---|---|---|
| １ | 〇 | 〇 | 〇 |
| ２ | 〇 | 〇 | 〇 |
| ３ | 〇 | 〇 | 〇 |
※１ フローチャート内の番号（返還なし１～５、または返還あり１～３）
※２ 返還額なし２については、簡易課税用の消費税等の確定申告書の写し
※３ 「B 消費税等の確定申告書の写し」については、以下のとおり確認を行った上で、県へ提出してください。
５ 提出方法
・以下の電子メールアドレスへ、送信してください。
coronazigyou4@pref.fukuoka.lg.jp
福岡県保健医療介護部 がん感染症疾病対策課 感染症対策係 宛
・提出の際は、ファイル名の冒頭に医療機関名を記載してください。
例：（〇〇病院）仕入控除税額報告書等（補助金名+第〇回交付決定（ない場合は不要））
・ＰＤＦ等への変換は行わないでください。必ずエクセル様式のまま提出してください。
・審査事務を効率的に行うため、電子メールで提出してください。
※やむを得ず電子メールで提出することができない場合は、以下の住所へ郵送してください。
〒812-8577（住所記載不要）
福岡県保健医療介護部 がん感染症疾病対策課 感染症対策係 宛
※宛名は、「福岡県〇〇補助金 仕入控除税額報告書在中」と記載してください。
６ 仕入控除税額報告書の提出後
【仕入控除税額（返納額）が０円の場合】
提出書類に不備等がある場合は、担当部署から御連絡をさせていただく場合があります。
提出書類に不備等がない場合は、お手続きは完了いたします。
※担当部署からの御連絡等は特段ございません。
【仕入控除税額（返納額）が０円でない場合（返納がある場合）】
提出書類を確認の上、準備が整い次第、補助金の返納に関する納入通知書を送付いたします。
納入通知書の記載内容を御確認の上、納入通知書に記載の期日までに返納していただきますようお願いします。
７ 関係資料
様式
各補助金に該当する様式をダウンロードしてください。
福岡県新型コロナウイルス感染症対策事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
福岡県新型コロナウイルス感染症疑い患者受入協力医療機関体制整備事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
福岡県新型コロナウイルス感染症患者等入院医療機関設備整備事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
福岡県帰国者・接触者外来等設備整備事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
福岡県新型コロナウイルス感染症専用外来事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
福岡県感染症検査機関等設備整備事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
福岡県新型コロナウイルス感染症により休業等となった医療機関の継続・再開支援に要する事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
福岡県新型コロナウイルス感染症重点医療機関体制整備事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
福岡県新型コロナウイルス感染症重点医療機関等設備整備事業費補助金 [Excelファイル／32KB]
（※ Excelに複数シートで構成されています。）
参考資料
「令和４年度新型コロナウイルス感染症緊急包括支援交付金（医療分）事業に係る消費税及び地方消費税の仕入控除税額（返還額）の報告について（事業者向け手引き）」 [PDFファイル／1.22MB]
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